红光治疗仪的治疗机理是对生物体产生光化学作用，使之产生重要的生物效应及治疗效果。细胞中线粒体对红光的吸收最大，在红光照射后，线粒体的过氧化氢酶活性增加，这样可以增加细胞的新陈代谢；使糖元含量增加，蛋白合成增加和三磷酸腺苷分解增加，从而加强细胞的新生，促进伤口和溃疡的愈合；同时也增加白血球的吞噬作用，提高机体的免疫功能，因而在临床上可以治疗多种疾病。从相当长阶段的临床试验和收集到的使用报告和论文中可以看到红光治疗法使用得当，并配以辅助药物可用于治疗细胞发育不良、溃疡、烧伤、耳鼻喉眼科等科的诸多疾病。

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